Trung tâm Kiểm soát bệnh tật Quảng Nam được thành lập dựa trên cơ sở hợp nhất các đơn vị: Trung tâm Y tế dự phòng; Trung tâm Phòng, chống Sốt rét - Bướu cổ; Trung tâm Truyền thông - Giáo dục sức khỏe; Trung tâm Phòng, chống HIV/AIDS; Trung tâm Chăm sóc Sức khỏe sinh sản, trực thuộc Sở Y tế tỉnh Quảng Nam.
Trung tâm có chức năng tham mưu và tổ chức thực hiện các hoạt động chuyên môn, kỹ thuật, nghiệp vụ về phòng, chống dịch, bệnh truyền nhiễm; bệnh không lây nhiễm; phòng, chống tác động của các yếu tố nguy cơ ảnh hưởng tới sức khỏe; quản lý sức khỏe cộng đồng; khám phát hiện, điều trị dự phòng và các dịch vụ y tế khác phù hợp với lĩnh vực chuyên môn trên địa bàn tỉnh theo quy định của pháp luật.
Trung tâm Kiểm soát bệnh tật Quảng Nam là đơn vị sự nghiệp y tế công lập trực thuộc Sở Y tế Quảng Nam, có tư cách pháp nhân, trụ sở, con dấu, tài khoản riêng tại Kho bạc Nhà nước và Ngân hàng theo quy định của pháp luật và chịu sự chỉ đạo, quản lý trực tiếp, toàn diện về chuyên môn, kỹ thuật, nghiệp vụ, tổ chức, nhân lực, hoạt động, tài chính và cơ sở vật chất của Sở Y tế Quảng Nam; chịu sự chỉ đạo, hướng dẫn, kiểm tra, thanh tra về chuyên môn, kỹ thuật, nghiệp vụ của Bộ Y tế.
