Hiện tỉnh Phú Yên đã hình thành vùng lúa chất lượng cao khoảng 10.000ha, tập trung tại các huyện Phú Hòa, Tây Hòa, Đông Hòa. Cây công nghiệp hằng năm ổn định và phát triển diện tích trồng mía, từng bước áp dụng giải pháp tưới tiên tiến cho vùng nguyên liệu của 2 nhà máy đường Tuy Hòa, Sơn Hòa với diện tích 19.000ha (Sơn Hòa, Sông Hinh...).
Cây hàng năm phát triển vùng ngô, lạc tập trung với diện tích 7.000ha tại các huyện Sông Hinh, Sơn Hòa, Tuy An, Tây Hòa, Phú Hòa. Cây rau an toàn theo mô hình VietGAP được quy hoạch là 880ha (toàn tỉnh), tập trung tại các huyện Đồng Xuân, Tuy An, Phú Hòa, Sơn Hòa, Tây Hòa, Đông Hòa và thị xã Sông Cầu và thành phố Tuy Hòa.
Hiện nay, vùng lúa chất lượng cao 10.000ha đang được cấp nước ổn định từ hồ Đồng Cam. Tuy nhiên, cần phải sửa chữa, nâng cấp trạm bơm Nam Bình để tưới ổn định 790ha, trong đó có 270ha mía, 470ha ngô tập trung và các loại cây trồng khác. Đồng thời, cần xây mới 23 công trình như hồ Mỹ Lâm, hồ Cà Lúi, hồ Sông Bạc, hồ Đồng Ngang, kênh đập sông Con... để tạo nguồn cấp nước cho gần 17.600ha, trong đó mía hơn 8.500ha; ngô, lạc, rau màu: 4.135ha và các cây khác.
Theo quy hoạch, vùng nuôi trồng thủy sản vùng nước lợ của tỉnh Phú Yên có tổng diện tích khoảng 2.200ha, tập trung ở hạ lưu sông Bàn Thạch (huyện Đông Hòa), đầm Cù Mông (thị xã Sông Cầu), đầm Ô Loan (huyện Tuy An); tôm giống được nuôi nhiều tại thị xã Sông Cầu với 85ha.
Giải pháp cấp nước cho các khu vực này là kéo dài kênh chính Đồng Cam cấp nguồn cho 180ha ở Tuy An. Kéo dài kênh chính đập Hà Yên cấp nước cho 84ha ở Tuy An. Xây dựng hồ Mỹ Lâm, cấp nước cho 952ha vùng Đông Hòa. Xây dựng hồ Đồng Ngang, cấp nguồn cho 120ha ở Tuy An và xây dựng hồ Đồng Sơn, cấp nguồn cho 30ha thị xã Sông Cầu.
