Lĩnh vực chăn nuôi, TP có 13 cơ sở SX giống gia súc, gia cầm. Trong đó có 8 cơ sở chăn nuôi heo SX con giống với khả năng cung cấp gần 5.000 con giống/năm và 5 cơ sở chăn nuôi vịt SX con giống chất lượng cao với khả năng cung ứng 700.000 - 750.000 con giống/năm.
Đối với nguồn giống thủy sản, TP Cần Thơ có 199 cơ sở SX, kinh doanh giống hằng năm SX được 219 triệu cá bột các loại, 879 triệu cá giống các loại và 1.051 triệu tôm post… Thời gian qua, Trung tâm Giống cây trồng, vật nuôi, thủy sản còn hợp tác với Viện Lúa ĐBSCL, hệ thống nhân giống lúa trên địa bàn tổ chức SX lúa giống với diện tích trên 300ha, sản lượng trên 1.300 tấn.
Đồng thời, hợp tác với ĐH Cần Thơ tuyển chọn bộ giống gà nòi có năng suất và chất lượng thịt tốt phục vụ nhu cầu gà giống cung cấp cho nông dân TP và các tỉnh ĐBSCL.
