Bộ GTVT chỉ đạo Chủ tịch HĐTV TCty Đường sắt Việt Nam quyết định đầu tư, chịu trách nhiệm về việc tổ chức quản lý thực hiện dự án nêu trên và được giao thầu (không thông qua lựa chọn nhà thầu) từ giai đoạn lập dự án, khảo sát, thiết kế, thi công xây dựng cho đến giai đoạn hoàn thành đưa công trình vào khai thác, sử dụng theo đúng quy định pháp luật.
Thủ tướng Chính phủ đồng ý với đề nghị của Bộ GTVT và TCty Đường sắt Việt Nam về việc bố trí 298,5 tỷ đồng từ nguồn dự phòng ngân sách trung ương năm 2016 cho TCty Đường sắt Việt Nam (Bộ GTVT) để thực hiện đầu tư công trình. Giao Bộ KH ĐT, Bộ Tài chính xử lý cụ thể theo quy định.
Trước đó, vào hồi 11h50’ ngày 20/3 đã xảy ra vụ một xà lan chạy trên sông Đồng Nai đâm vào trụ cầu Ghềnh tại lý trình Km 1699+860 tuyến đường sắt Bắc-Nam khiến cầu bị sập 2 nhịp, cắt đứt lưu thông trên tuyến đường sắt Bắc-Nam. Vụ việc đã ảnh hưởng nghiêm trọng đến ngành đường sắt.