Theo Kế hoạch đề ra mục tiêu phấn đấu đến năm 2020, tốc độ tăng giá trị sản xuất thủy sản bình quân hàng năm đạt 7,6%; Tổng sản lượng thủy sản đạt 216.000 tấn; Giá trị xuất khẩu thủy sản đạt 25 triệu USD.
Cũng theo kế hoạch, tăng dần số lượng tàu thuyền đánh bắt xa bờ có công suất 400CV trở lên, giảm dần số lượng tàu thuyền đánh bắt ven bờ có công suất dưới 90CV. Tổng số lượng tàu thuyền giảm còn 5.300 chiếc, với tổng công suất 1.600.000CV. Đến năm 2020, giảm tỷ lệ nghề lưới kéo tầng đáy xuống dưới 25%; tăng nghề rê khơi lên 30%, nghề rê câu lên 18% và nghề nghề vây đạt 13%.
Bên cạnh đó, đầu tư hoàn chỉnh đồng bộ một số vùng nuôi tôm công nghiệp áp dụng các quy trình nuôi kỹ thuật tiên tiến, thực hành nuôi tốt (GAP), nuôi có trách nhiệm (CoC). Xây dựng cơ sở vật chất Khu bảo tồn biển Lý Sơn, thực hiện thí điểm mô hình đồng quản lý nghề cá. Đến năm 2020, tập trung đầu tư xây dựng hoàn thành các cảng cá, khu neo đậu trú bão tàu cá và các trung tâm dịch vụ hậu cần nghề cá tại các vùng cửa biển. Xây dựng hình thành 1-2 chuỗi liên kết sản xuất (khai thác, nuôi trồng) - chế biến - tiêu thụ sản phẩm thủy sản.
